После захвата французами в 1798 году, земля вокруг Бутринта попала под влияние Османской империи и оставалась "турецкой" до 1912 года. Самым видным Оттоманским агентом в области в это время был печально известный Али Паша Тепеленский (1741-1822). Али Паша построил ряд устрашающих крепостей, поскольку территория его владений неустанно возрастала. К его владениям относились Тепелена, Гирокастра, Иоаннина – где он сделал свой капитал – так же как Ликурс, в нескольких милях на север от Бутринти на холмах. В замке часто устраивались празднования для того, чтобы принести возобновленное процветание в Эпир. Среди приглашенных были и известные Западные эмиссары; поэт Лорд Байрон описал свою встречу с Али Пашой в 1809 году в своем романе "Паломничество Чайлд Гарольда". Маленькая крепость в устье Канала Вивари часто приписывалась Али Паше, хотя она появляется на венецианской кадастровой карте только 1718 году и, возможно, была владением семьи Сорфиот Гонеми.