Церковь святой Варвары была основана ещё в 1888 году, при военном госпитале. Помощь оказал император Российской империи Александр. В 1905 году церковь Св. Варвары была передана патриархии. В 1906 году храм празднично освятили, но службу на грузинском языке не вели ещё долго. Вскоре Батумским губернатором Дрягиным, наместником Воронцовым-Дашковым и известным священником Восторговым церковь была передана в ведомство военных.
В 1996 году, по личной инициативе лидера Аджарской автономной республики А. Абашидзе и при его помощи, при сносе госпиталя было построено новое здание церкви. 7 апреля 1997 года, в праздник благовещения, в торжественной обстановке открылась церковь Св. Великомученицы Варвары. Храм освятил Батумский и Схалтский епископ Димитрий.
Церковь состоит из двух строений, связанных друг с другом арочной галереей, в плане она прямоугольная, с западной стороны, где алтарь, полукруглая. Наверху, в области церковного фронтона размещена открытая арочная колокольня. Интерьер церкви хорошо освещен, в угловых частях фасада, поодаль от стен есть обрамленные арочные ниши.